Fue asentamiento de grupos totonacas, posteriormente quedó sometido
a la "triple alianza" México-Texcoco-Tlacopan. Al establecerse los
encomendadores españoles la denominaron San Juan Ahuacatlán.
Perteneció al antiguo Distrito de Zacatlán. En 1895, fecha
en que se aplicó el sistema de Distritos y Municipalidades, se constituyó
como Municipio Libre .
El 17 de julio de 1812 se defiende la población contra los conservadores
que apoyaban al Imperio Francés. Por Decreto del Gobierno Superior
del Estado, el 2 de abril de 1900, se erige en Villa de Ahuacatlán
de Santos Degollado, para honrar la memoria del Mártir de la Reforma.
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