El nombre de Amatenango significa, en náhuatl '€œlugar de amates'€Â.
El grupo de tzeltales, que originalmente formaron el pueblo, se estableció
en el municipio durante el período clásico de la época
precolombina. En 1486 fue invadido por las tropas aztecas al mando de Tiltototl.
Después de la conquista de Chiapas (1528) es citado como perteneciente
a Teopisca; pero a finales del siglo XVI se había convertido en
cabecera por derecho propio. Los misioneros españoles establecidos
en la región le antepusieron a Amatenango el nombre de San Francisco.
Los pobladores del municipio participaron activamente en la sublevación
indígena de 1712. En el Censo de Población de 1900, aparece
ya como municipio y con el nombre de Amatenango.
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