Antes de la llegada de los conquistadores españoles, el territorio
del municipio formaba parte de la nación Tzotzil. En la primera
parte de la Colonia los frailes dominicos encargados de la evangelización
de la zona, le antepusieron el nombre de San Pedro a Chenalhó. A
finales del siglo XVI aparece como una parcialidad del pueblo de San Pedro
Huitiupán. En 1711, estalla en el pueblo de San Pedro Chenalhó
una sublevación indígena encabezada por Sebastián
Gómez. En 1869, los habitantes del municipio participaron activamente
en la Guerra de Castas, encabezada por el líder chamula Pedro Díaz
Cuscat. Por decreto promulgado el 13 de febrero de 1934, siendo Gobernador
Constitucional del Estado Victórico R. Grajales, se modifica la
denominación del pueblo de San Pedro Chenalhó por Chenalhó.
El 29 de enero de 1970, siendo Gobernador Constitucional del Estado José
Castillo Tiélemans, se da curso al expediente de reconocimiento
y titulación de los bienes comunales del pueblo de Chenalhó.
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