Poblado prehispánico, se llamó primitivamente Chistic o
Xictic y estuvo habitado en un principio por tribus
toltecas. Estaba bajo el dominio del señorío de
Tonallán. En 1524 llegó a este lugar Francisco Cortés
de San Buenaventura y en 1530 lo hizo Nuño de Guzmán
pero el encomendero que había dejado Francisco Cortés,
Juan de Escárcena, no permitió que se apoderara de
dicha región. En enero de 1542 estuvo en este lugar el
virrey D. Antonio de Mendoza quien se dirigía a aplacar
una gran rebelión de indígenas.
El poblado fue fundado por los años de 1740, el 28 de
junio, por Fray Antonio de Jesús quien además levantó
el templo por encomienda del obispo Gonzalo Hermosillo;
estableciéndose 20 españoles y más de 50 indígenas,
para explotar los yacimientos de oro que había en la
zona.
En 1825, San Marcos no tenía Ayuntamiento y dependía
del departamento y 5° cantón de Etzatlán. En 1878 pasó
a pertenecer al departamento de Ahualulco, que a su vez
se había convertido en cabecera del 5° cantón. En el
'Ensayo Estadístico del Estado de Jalisco'€ de Mariano
Bárcena (1888); se menciona a San Marcos con categoría
de pueblo y como comisaría de elección popular del
municipio de Etzatlán.
En 1895 fue comisaría política del municipio de
Etzatlán que a su vez dependía del departamento de
Ahualulco en el 12° cantón que tenía por cabecera a la
misma municipalidad. El municipio de San Marcos fue
erigido como tal por decreto número 1212 expedido el 17
de abril de 1907, entrando en vigor el 1° de enero de
1908.
Videos San Marcos Jalisco