El territorio que actualmente ocupa el municipio de Etchojoa, fue ocupado
por la Tribu Mayo, que le da su nombre tanto al valle circundante como
al río que lo atraviesa.
En 1613 fue visitado por primera vez por el misionero jesuita Pedro
Méndez. Fue pueblo de visita de la Misión de Santa Cruz del
Río Mayo, Etchojoa es además uno de los siete pueblos mayos
tradicionales.
Es además, uno de los siete pueblos mayos tradicionales. Etchojoa
obtuvo la categoría de municipio en la segunda mitad del siglo XIX
y estuvo adscrito al distrito de Alamos hasta la desaparición de
éstos en 1917. En 1909 Etchojoa fue declarado municipio. Entre los
acontecimientos históricos más relevantes es de mencionar
el de 1934, año en el que el Presidente de la República General
Lázaro Cárdenas, llevó a cabo el reparto agrario.
En 1796, una vez que el sistema misional entró en decadencia,
fueron titulados dos sitios de ganado mayor de los predios de Etchojoa
a Marcos Valenzuela. Fue entonces cuando se inició el proceso de
mestizaje de la población.
Después de la Independencia y a raíz de las rebeliones
indígenas de 1825 y 1829, Etchojoa estuvo sometido a la ley particular
para el gobierno de los pueblos indígenas del 30 de septiembre de
1928, que establecía capitanes y tenientes militares como parte
del gobierno interior de los mismos.
Etchojoa obtuvo la categoría de municipio en la segunda mitad
del siglo XIX, con base en la Constitución Local de 1857 y estuvo
adscrito al distrito de Alamos hasta la desaparición de los distritos
en 1917. En 1909 Etchojoa fué declarado municipio.
En 1919, un decreto del Congreso fijó los límites del
municipio con los de Navojoa y Huatabampo.
En la década de 1930-1940 hubo un despegue agrícola,
a raíz de los primeros desmontes y dotaciones agrarias que propició
una aceleración del crecimiento demográfico. En esta etapa
surgieron las poblaciones de Bacobampo y la Colonia Irrigación,
posteriormente denominada Villa Juárez, entre muchas otras poblaciones
y ejidos del municipio.
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